1. Telur

• Fungi: Saprolegnia dan keluarga.
• Protozoan: Carchesium (Walleye dan Trout), Epistylis (Catfish), Pleistophora variae (Golden Shiner), sulci (Polyodon spathula ), dan Thelohania baueri (Pungitius pungitius),

2. Kumis

• Protozoa: Henneguya (Ictalurus nebulosus), Ichthyophthirius (terkadang).
• Trematoda: Gyrodactylus

3. Kulit dan Sirip

• Fungi: Saprolegnia dan keluarga, Exophiala pisciphila
• Protozoa: Ambiphrya, Amphileptus, Bodomonas, Chilodonella, Colponema, Cyclochaeta, Epistylis, Ichthyoboda, Ichthyophthirius, Oodinium, Trichodina, Trichophrya, Microsporidea, Myxosporidea, Myxobolus squamalis
• Monogenea: Gyrodactylus,
• Trematoda: Neascus (black spot)
• Crustacea: Argulus, Lernaea, Ergasilus, Salmincola.

4. Lubang Hidung

• Protozoa: Apiosoma , Amphileptus, Chilodenella, Myxobolus, Tetrahymena, Trichodina, Trichodinella.
• Monogenea: Aplodiscus nasalis (Hypentellium etowanum), Cleidodiscus monticelli, Pellucidhaptor catostomi, P. nasalis, P.
• Nematoda: Philometra (bluegills danlargemouth black bass)
• Copepoda: Ergasilus megaceros (fallfish dan catfish), Ergasilus rhinos (centrarchids), Gamidactylus, Gaminispatulus, Gaminispinus, Lernaea, Paragasilus,

5. Insang

• Fungi: Dermocystidium
• Protozoa: Ambiphrya, Amphileptus, Bodomonas, Chilodonella, Cryptobia, Dermocystidium, Epistylis, Ichthyoboda (Costia), Ichthyophthirius, Microspora, Myxosporea, Piscinoodinium, Trichodina, Trichophrya
• Monogenea: Gyrodactylus, Dactylogyrus, Cleidodiscus, dan masih banyak spesies lain
• Trematoda: Sanguinicola
• Copepoda: Achtheres, Argulus, Lernaea, Ergasilus, Salmincola, Lepeophtheirus

6. Mulut

• Protozoa: Apiosoma, Myxosporea
• Trematoda: Leuceruthrus
• Nematoda: Philometra nodulosa (pada ikan Suckers dan Buffalo Fishes)
• Copepoda: Lernaea cyprinacea, Salmincola (S. lotae pada ikan Burbot)

7. Darah

• Protozoa: Trypanosoma (Cryptobia), Trypanoplasma, Babesiosoma, Dactylosoma, Haemogregaerina dalam sel darah merah, Kudoa, Sphaerospora
• Trematoda: Sanguinicola pada pembuluh darah, termasuk pembuluh darah pada insang
• Nematoda: Philometra sanguinea in pada pembuluh darah sirip ekor ikan mas, P. obturans pada pembuluh darah insang ikan Pike

8. Kerongkongan

• Trematoda: Azygia, Cotylaspis, Derogenes, Halipegus, Proterometra

9. Perut

• Protozoa: Schizamoeba
• Monogenea: Enterogyrus , Enterogyrus sp.
• Trematoda: Allocreadium, Aponeurus, Azygia, Caecincola, Centrovarium, Derogenes, Genolinea, Hemiurus, Leuceruthrus
• Nematoda: Haplonema

10. Usus

• Protozoa: Hexamita, Schizamoeba, Eimeria.
• Trematoda: Allocreadium, Crepidostomum, Lissorchis,
• Cestoda: Proteocephalus, Bothriocephalus, Eubothrium.
• Nematoda: Contracaecum, Camallanus,
• Acanthocephala: Neoechinorhynchus, Echinorhynchus,

11. Gelembung Renang

• Trematoda: Acetodextra
• Nematoda: Cystidicola , Huffmanella huffmanella

12. Selaput rongga perut, Hati, Limpa

• Fungi: Ochroconis humicola,; O. tshawytscha, Phoma herbarum.
• Protozoa: Myxosporea, Microsporea, Goussia
• Trematoda: Ornithodiplostomum, Posthodiplostomum, Paurorhynchus, Acetodextra (pada ikan Lele)
• Cestoda: Diphyllobothrium, Haplobothrium, Ligula, Proteocephalus, Schistocephalus, Triaenophorus.
• Acanthocephala: Echinorhynchus salmonis, Leptorhynchoides thecatus, Pomphorhynchus bulbocolli
• Nematoda: Philonema,
• Copepoda: Lernaea.

13. Kantung Empedu

• Protozoa: Myxosporea, Hexamita.
• Trematoda: Crepidostomum cooperi, C. farionis, Derogenes , Plagioporus sinitsini, Prosthenhystera sp., Pseudochaetosoma.
• Cestoda: Eubothrium salvelini, Dilepidae (Pleurocercoids)
• Nematoda: Rhabdochona , Capillaria catostomi

14. Saluran Empedu

• Trematoda: Phyllodistomum

15. Ginjal

• Fungi: Ichthyophonus hoferi, Ochroconis
• Protozoa: Myxosporea
• Trematoda: Nanophyetus salmincola, Posthodiplostomum minimum centrarchi, Phyllodistomum pada saluran kencing dan ginjal.

16. Kandung Kemih

• Protozoa: Myxosporea, Vauchomia (trichodinid) pada Esox
• Monogenea: Acolpenteron.
• Trematoda: Phyllodistomum.

17. Indung Telur (Ovarium)

• Protozoa: Henneguya oviperda pada ikan Esox lucius, Pleistophora ovariae pada ikan Golden Shiners, Thelohania baueri pada ikan Gasterosteus aculeatus,
• Trematoda: Acetodextra ameiuri
• Nematoda: Philonema pada ikan Salmon
• Cestoda: Proteocephalus

18. Testis (Kantung sperma)

• Protozoa: Hexamita
• Cestoda: Proteocephalus

19. Mata

• Protozoa: Henneguya episclera pada ikan Lepomis gibbosus, H. zikaweiensis pada ikan Carassius auratus, Myxobolus corneus pada korna ikan Lepomis macrochirus, M. hoffmani pada selaput mata ikan Pimephales promelas
• Digenea: Diplostomum spathaceum pada lensa mata, Diplostomulum scheuringi di cairan pada mata.
• Nematoda: Philometroides di rongga bola mata pada ikan southeastern centrarchids

20. Tulang Rawan

• Protozoa: Henneguya brachyura pada ikan Notropis , H. schizura pada ikan Esox lucius, Henneguya sp. pada ikan Pomoxis spp., M. cartilaginis pada ikan Centrarchids, Myxobolus cerebralis pada ikan salmonids, M. hoffmani pada ikan Pimephales promelas, M. scleropercae pada ikan Perch

21. System Saraf

• Fungi: Ichthyophonus hoferi pada otak
• Protozoa: Mesencephalicus pada otak ikan Cyprinus carpio (Europe), Myxobolus cerebralis mengganggu CNS (Central Nervous System / System Saraf Pusat), M. hendricksoni pada otak ikan Pimephales promelas, M. arcticus, M. kisutchi, M. neurobius pada CNS ikan Salmonids
• Trematoda: Diplostomulum, Euhaplorchis, Ornithodiplostomulum, Parastictodora, Psilostomum

22. Jaringan Otot

• Protozoa: Myxobolus insidiosus pada ikan Cutthroat Trout, Chinook dan Coho Salmon, Heterosporis pada ikan Yellow Perch, serta beberapa Myxosporea dan Microsporea
• Trematoda: Clinostomum dan black spot (Neascus )
• Cestoda: Larval Diphyllobothrium, Triaenophorus
• Nematoda: larval Eustrongylides

Sumber: Parasites of North American freshwater fishes by Glenn L. Hoffman 1999

Penyakit akibat infeksi Organisme patogen yang menyebabkan infeksi biasanya berupa parasit, jamur, bakteri, dan virus. Produksi benih ikan secara masal masih menemui beberapa kendala antara lain karena sering mendapat serangan parasit Ichthyoptirus multifilis (white spot) sehingga banyak benih ikan yang mati, terutama benih yang berumur 1-2 bulan. Dalam usaha pembesaran ikan belum ada laporan yang mengungkapkan secara lengkap serangan penyakit pada ikan, untuk pencegahan, beberapa penyakit akibat infeksi berikut ini sebaiknya diperhatikan.

Penyakit parasit

Penyakit white spot (bintik putih) disebabkan oleh parasit dari bangsa protozoa dari jenis Ichthyophthirius Multifiliis.

Ichthyophthirius Multifiliis.

Pengendalian:
Menggunakan Methylene Blue konsentrasi 1% (satu gram metil biru dalam 100 cc air). Ikan yang sakit dimasukkan ke dalam bak air yang bersih, kemudian kedalamnya masukkan larutan tadi. Ikan dibiarkan dalam larutan selama 24 jam. Lakukan pengobatan berulang-ulang selama tiga kali dengan selang waktu sehari.

Penyakit jamur

Penyakit jamur biasanya terjadi akibat adanya luka pada badan ikan, atau dengan kata lain penyakit jamur adalah penyakit sekunder yang diawali dengan luka pada badan ikan.

Penyebab penyakit jamur adalah Saprolegnia sp. dan Achlya sp. Pada kondisi air yang jelek, kemungkinan ikan terserang jamur lebih besar.

Saprolegnia Sp.

Pencegahan penyakit jamur dapat dilakukan dengan cara menjaga kualitas air agar kondisinya selalu ideal bagi kehidupan ikan. Ikan yang terlanjur sakit harus segera diobati. Obat yang biasanya dipakai adalah Malachite green oxalate sejumlah 2 –3 g/m air (1 liter) selama 30 menit.

Achlya

Caranya rendam ikan yang sakit dengan larutan tadi, dan diulang sampai tiga hari berturut- turut.

Penyakit bakteri

Penyakit bakteri juga menjadi ancaman bagi ikan. Bakteri yang sering menyerang adalah Aeromonas sp. dan Pseudo-monas sp. Ikan yang terserang akan mengalami pendarahan pada bagian tubuh terutama di bagian dada, perut, dan pangkal sirip. Penyakit bakteri yang mungkin menyerang ikan patin adalah penyakit bakteri yang juga biasa menyerang ikan-ikan air tawar jenis lainnya, yaitu Aeromonas sp. dan Pseudomonas sp. Ikan patin yang terkena penyakit akibat bakteri, ternyata mudah menular, sehingga ikan yang terserang dan keadaannya cukup parah harus segera dimusnahkan.

Aeromonas Hydrophila

Sementara yang terinfeks, tetapi belum parah dapat dicoba dengan beberapa cara pengobatan. Antara lain:

– Dengan merendam ikan dalam larutan kalium permanganat (PK) 10-20 ppm selama 30–60 menit,
– Merendam ikan dalam larutan Nitrofuran 5- 10 ppm selama 12–24 jam,
– Merendam ikan dalam larutan Oxytetracycline 5 ppm selama 24 jam.

sumber : http://www.iptek.net.id