Microsporidians

Kadang parasit ini menyusup ke otot dan organ dalam ikan Patin. Kehadiran microsporidians tidak terlalu membahayakan ikan Patin, namun kehadiran spesies tertentu dapat secara signifikan mengurangi kualitas dan daya tarik fillet.

Myxobolus, Henneguya. 

Spesies Myxobolus dan Henneguya umumnya ditemukan pada ikan Patin. Parasit ini menyebabkan luka serius dan kematian. Dan dapat menyebakan tekstur daging ikan rusak dan tidak memiliki nilai aestetika sehingga tidak memiliki nilai jual di pasaran.  Fase presporogonik pada parasit tertentu menyebabkan inflammasi pada gelembung renang dan penyakit pembesaran ginjal. Infeksi dapat tersebar luas, namun tidak ada pengobatan yang efektif. Untuk mengontrol parasit ini lakukan pengeringan dan pengapuran kolam sebelum bibit Patin ditebar.